患有某些器质性疾病的患者，往往伴有紧张、忧愁等情志变化，通过气功锻炼也可改善患者的情志障碍，并进一步通过心理—生理—形态反应环节使病变的实质得到一定程度的修复。所以对器质性病变多可选用以其它疗法为主，辅以气功疗法的方式。
总之，气功疗法可对心理障碍、功能失调及某些器质性病变分别发挥不同的作用，但也并不象有的人宣传的那样，似乎气功可以包治百病并可迅速见效。其实气功是需长期修练的。一些江湖气功师，不分病情轻重，要求患者一律停止其它治疗，只用气功治疗，这是极不妥当的。对于一些重病、久病病人，由于初接触气功，对其功理、功法一时不能熟练地掌握，可把气功作为一种辅助治疗手段，等患者摸到门道，逐渐熟练掌握了练功方法并有了疗效后，才可酌情确定气功在以后治疗中的主、辅位置。
